Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Костромская государственная сельскохозяйственная академия» было создано в соответствии с приказом Министерства высшего образования СССР от 13 августа 1949 г. № 1057 как Костромской сельскохозяйственный институт, который переименовывался приказами: Государственного комитета Российской Федерации по высшему образованию от 29 апреля 1994 г. № 355 — в Костромскую государственную сельскохозяйственную академию; Министерства сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации от 17 марта 1997 г. № 108 — в государственное образовательное учреждение Костромскую государственную сельскохозяйственную академию; приказом Министерства сельского хозяйства Российской Федерации от 5 февраля 2002 г. № 84 — в федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Костромская государственная сельскохозяйственная академия».

Академия является некоммерческой организацией, имеет государственную аккредитацию, осуществляет свою деятельность на основе лицензии на право ведения образовательной деятельности в сфере образования.

В структуру академии входят факультеты:

Агробизнеса
Архитектурно-строительный
Ветеринарной медицины и зоотехнии
Инженерно-технологический (механизации сельского хозяйства)
Экономический
Электрификации и автоматизации сельского хозяйства
Факультет заочного образования